Другие поля MEDLINE

Хотя MESH термины и являются важнейшим компонентом системы MEDLINE, в базе библиографических данных имеется ряд других полей, которые являются чрезвычайно полезными для точной формулировки запроса. Приведем описания важнейших из них.

Поле "Имя автора" [AU]

Данное поле в системе PubMed содержит информацию о всех авторах данной статьи (точнее это правило подвергалось пересмотру на протяжении истории PubMed, см. ниже). Информация содержится в виде фамилии автора и его инициалов, которые записываются без знака точки (например, Klimov AN). Про возможность поиска по данному полю следует помнить, когда необходимо расширить условия поиска, особенно для авторов, которые могут публиковать свои работы не только на английском. Дело в том, что индексирование MESH терминами не англоязычных статей не всегда столь эффективно, как работ, опубликованных на английском языке. Поэтому после обнаружения публикации автора, который не работает в англоязычной стране или в любом другом случае, когда существует возможность публикаций на другом языке, следует повторить поиск по фамилии автора. Так, например, поиск публикаций одного российского автора по MESH терминам, относящимся к теме его работы принес только одну ссылку, опубликованную в 1979 году, тогда как поиск по его фамилии принес более ста ссылок, опубликованных на протяжении последних 30 лет, большая часть которых была посвящена искомой проблеме.

Еще одним возможным способом использования поиска по фамилии автора является сужение поиска. Так, если пользователя интересует точка зрения Нобелевского лауреата, соавтора открытия рецепторов липопротеидов низкой плотности М. Брауна, на использование гиполипидемических средств группы статинов, можно сформулировать следующий запрос (необходимо помнить, что статины в словаре MESH терминов классифицируются по "родительскому" химическому соединению - нафталенам):

Naphtalenes [MH] AND Brown [AU]

Запрос можно немного сузить, используя только наименования статинов и указав инициалы автора

(lovastatin [MH] OR simvastatin [MH]) AND Brown M [AU]

Правила учета авторов в библиографической ссылке менялись следующим образом:

 

Поле "Язык" [LA]

Наиболее адекватный метод работы с литературой предполагает, что найдя ссылку и оценив интерес и основное содержание статьи, пользователь предпримет попытки нахождения полного текста этой публикации. В этих условиях ссылки на работы, опубликованные на языках, которыми не владеет исследователь при условии, что он не может организовать перевод, представляют собой балластную информацию, которую желательно было бы отбросить на этапе поиска. Для этого существует специализированное поле "Язык", в котором указывается, на каком языке было опубликована та или иная статья. Наименование языка вводится на английском языке. Например, если у исследователя есть возможность читать статьи на русском, английском и немецком языке, и его интересуют статьи по контрацептивным средствам для мужчин, запрос может выглядеть следующим образом:

Contraceptive Agents, Male [MH] AND (English [LA] OR Russian [LA] OR German [LA])

Сразу следует отметить, что публикация на языке, отличном от английского не означает, что исследователь не может получить информацию о данном проекте. В большинстве случаев, публикации снабжаются резюме на английском языке, поэтому исследователь может выявить публикации, имеющие резюме используя ключевое слово hasabstract. Тогда запрос на поиск статей по описанной выше теме, но которые были опубликованы либо на английском или русском языках, либо хотя бы имеют резюме, будет выглядеть следующим образом:

Contraceptive Agents, Male [MH] AND (English [LA] OR Russian [LA] OR hasabstract)

Поле "Место работы" [AD]

Данное поле предназначено для хранения информации о месте, где была выполнена опубликованная работа. В этом поле может хранится как официальное название организации (взятое из соответствующего раздела публикации), так и номер гранта, если исследование проводилось на территории США и спонсировалось национальными институтами здоровья. Эти номера для пользователей из других стран вряд ли могут иметь большое значение. Поэтому российский пользователь может помнить только тот факт, что в данном поле хранится информация об основном месте работы автора публикации. Эта информация может оказаться полезной для поиска публикаций, по теме сходных с основной темой исследования, но описанных таким образом, что для их классификации использовались иные MESH термины. Дело все в том, что обычно научные лаборатории занимаются одной проблемой, работают в одном направлении, хотя в них могут имеется и разные рабочие группы, что будет приводить к разному авторству статей, Именно в этой ситуации может помочь поиск по месту работы. Еще одной причиной использования поиска по этому полю является выявление статей по данной теме, опубликованных одной и той же группой исследователей. Поскольку высока вероятность, что статьи, вышедшие из одной лаборатории буду содержать сходные результаты, обнаружение того факта, что несколько человек принадлежат к одной исследовательской группе спасет автора от неудобной ситуации с цитированием одних и тех же результатов как полученных разными исследователями и, значит, заслуживающими большего доверия.

Поля нахождения ссылки: наименование журнала [TA], том [VI], выпуск [IP] и страницы [PG]

Система PubMed хранит информацию о местонахождении журнальной ссылки в нескольких полях - наименование журнала, том, выпуск и начальная страница публикации. Если поле журанал еще может использоваться для информационного поиска (просмотр всех статей в New England Journal of Medicine за последний год), то остальные поля семейства могут понадобиться только для верификации ссылки (они, естественно, нужны смой системе для хранения библиографической информации). Тем не менее, верификация ссылок является чрезвычайно важным мероприятием, особенно если ссылки вводятся вручную, а не загружаются в библиографическую программу напрямую с сайта NLM. В принципе национальная медицинская библиотека предлагает несколько режимов проверки ссылок (т.н. Citation maker и Batch citation maker), однако мы сейчас остановимся лишь на непосредственном использовании для этих целей языка запросов PubMed

Для начала необходимо знать название журнала. Теоретически возможна попытка поиска ссылки если известен год публикации, том и выпуск,

Поиск журнала производится при помощи поля "Имя журнала" [TA] – куда записано сокращенное наименование журнала и его индекс. Однако ввести можно и полное наименование журнала, поскольку в этом случае система PubMed просмотрит наименование в таблице соответствия журналов и сама правильно определит сокращение. Поэтому возможен ввод сокращений, полного наименования или индекса, так что запросы J Biol Chem [TA], Journal of Biological Chemistry [TA] или 0021-9258 [TA] дадут аналогичные результаты

Подвыборка журналов и другие подвыборки

Для облегчения поиска пользователь может осуществлять поиск по тематической выборке журналов. Для того, чтобы воспользоваться этой функцией надо ввести ключевое слово jsubset? где вместо вопросительного знака подставляется сокращение той или иной подборки журналов в соответствии со следующим правилом:

Соответственно, запрос на поиск информации о контрацептивных устройствах в журналах по оценке технологий будет выглядеть следующим образом

Contraceptive Devices [MH] AND jsubsett

Tа же тема в жураналах, посвященных репродуктивному здоровью

Contraceptive Devices [MH] AND jsubsetr

MEDLINE поддерживает еще два типа подвыборок - тематические и источник цитаты. Тематических подвыборок семь:

Для того, чтобы выполнить поиск в тематической подвыборке надо указать ее название с указанием идентификатора поля [SB], например Asthma [MH] AND cam [SB] может быть использовано для поиска статей по лечению астмы с использованием методов нетрадиционной медицины

Тематическая подвыборка AIDS используется для поиска статей посвященных инфекции ВИЧ и СПИД. Она базируется на поисковой стратегии, разработанной библиографами NLM при создании базы AIDSLINE. Так, например для того, чтобы найти статьи, посвященные ВИЧ инфекции при тубекркулезе можно использовать запрос tuberculosis [MH] AND aids [SB]

Подвыборка публикаций по биоэтике может быть просмотрена при помощи стратегии разработанной специалистами Интститута Этики им. Кенедди. Эта стратегии включается в поиск при помощи указателя bioethics [SB]. Пример может явиться запрос на поиск статей по эвтаназии: euthanasia AND bioethics [sb]

Публикации по истории медицины выявляются при помощи идентификатора history [SB], по токсикологии при помощи указателя tox [SB] и публикации, полезные для специалистов в области аэрокосмической медицины - при помощи идентификатора space [SB]. Таким образом, публикации, посвященные историческим аспектам изучения сибирской язвы могут быть найдены при помощи следующего запроса anthrax AND history [SB]

Еще одним чрезвычайно важной подвыборкой является подвыборка систематических обзоров. Она базируется на стратегии, которая была разработана для того, чтобы выявлять публикации, обозначенные как систематические обзоры, мета-аналитические статьи, обзоры клинических испытаний, статьи, посвященные доказательной медицине, клинические рекомендации, конференции экспертов и другие ссылки из журналов, специализирующихся на составлении обзоров литературы для клиницистов. Эту, достаточно сложную стратегию поиска можно использовать указав лишь только идентификатор systematic [SB], например Tourette Syndrome [MAJR] AND systematic [SB]

Источником цитаты может быть собственно основная база данных MEDLINE, PreMEDLINE, доступная для поиска данных база, в которой находятся наиболее новые ссылки, процесс контроля которых библиографами еще не закончен, а также цитаты, которые в электронной формы были представлены издателями (и, соответственно прошли еще менее жесткий контроль адекватности ключенвых слов). Для поиска в одном из этих поднаборов можно использовать слова MEDLINE, PREMEDLINE или PUBLISHER с идентификатором поля [SB]. Так, поиск информации о контрацептивных устройствах в основной базе MEDLINE можно заказать следующим образом: Contraceptive Devices [MH] AND Medline [SB]

Располагая названием журнала можно указать более детальные выходные данные номер тома и выпуск (номер журнала). Проверка ссылки на статью, опубликованную в журнале Lancet, том 357, номер 9256 будет выглядеть следующим образом

Lancet [TA] AND AND 357 [VI] AND 9256 [IP]

Следует помнить, что тома обычно нумеруются подряд, каждый год или несколько раз в год выпускается новый том, поэтому том является в некотором смысле и идентификатором года. Если он есть указывать год публикации в большинстве случаев не надо

Поле "Дата публикации" [DP]

Дата публикации вводится в формате ГОД/МЕСЯЦ/ДЕНЬ, причем год должен быть введен как четырехзначное число, месяц и день как двузначные. Так, например, 3 декабря 1999 года будет выглядеть следующим образом 1999/12/03[DP] . При этом указывать день и месяц не обязательно, поле даты будет правильно проанализировано и если введен только год. Для указания диапазона дат используется двоеточие, например диапазон дат с 1999 по 2002 год будет записан следующим образом - 1999:2002 [DP]. В PubMed существует несколько полей, содержащих дату - собственно дат публикации [DP], дата внесения ссылки в систему [EDAT] и дата, когда ссылка была проиндексирована MESH терминами [MHDA]

Подзаголовки (поле [SH])

Как подробно описывалось выше, в разделе, посвященном MESH терминам, у каждого термина могут иметься подзаголовки (subheadings), которые уточняют тему поиска. (например при поиске статей, посвященных диетотерапии рака, диетотерапия будет являться подзаголовком (neoplasms/diet therapy [MAJR])

При желании можно использовать для подзаголовков идентификатор поля [SH]

Табл.1 Подзаголовки, используемые в системе MEDLINE

Русский эквивалент

Подзаголовок

Сокращение

Агонисты

Agonists

AG

Анализ

Analysis

AN

Аналоги и производные

Analogs and Derivatives

AA

Анатомия и гистология

Anatomy and Histology

AH

Аномалии

Abnormalities

AB

Антагонисты и ингибиторы

Antagonists and Inhibitors

AI

Биосинтез

Biosynthesis

BI

Ветеринарный

Veterinary

VE

Вирусология

Virology

VI

Врожденные

Congenital

CN

Вторичная

Secondary

SC

Выделение и очистка

Isolation and Purification

IP

Генетика

Genetics

GE

Диагностика

Diagnosis

DI

Диагностическое использование

Diagnostic Use

DU

Диетотерапия

Diet Therapy

DH

Законодательство и юриспруденция

Legislation and Jurisprudence

LJ

Иммунология

Immunology

IM

Иннервация

Innervation

IR

Инструментарий

Instrumentation

IS

Использование

Utilization

UT

История

History

HI

Классификация

Classification

CL

Кровоснабжение

Blood Supply

BS

Кровь

Blood

BL

Лекарственная терапия

Drug Therapy

DT

Лекарственные эффекты

Drug Effects

DE

Метаболизм

Metabolism

ME

Методы

Methods

MT

Микробиология

Microbiology

MI

Моча

Urine

UR

Недостаточность

Deficiency

DF

Образование

Education

ED

Организация и администрирование

Organization and Administration

OG

Осложнения

Complications

CO

Отравления

Poisoning

PO

Паразитология

Parasitology

PS

Патогенез

Pathogenicity

PY

Патология

Pathology

PA

Патофизиология

Physiopathology

PP

Передача

Transmission

TM

Побочные эффекты

Adverse Effects

AE

Повреждения

Injuries

IN

Предложение и распределение

Supply and Distribution

SD

Применение и дозировка

Administration and Dosage

AD

Противопоказания

Contraindications

CT

Профилактика и контроль

Prevention and Control

PC

Психология

Psychology

PX

Рабочая сила

Manpower

MA

Радиационные эффекты

Radiation Effects

RE

Радиография

Radiography

RA

Радиотерапия

Radiotherapy

RT

Реабилитация

Rehabilitation

RH

Рост и развитие

Growth and Development

GD

Секреция

Secretion

SE

Сестринское дело

Nursing

NU

Смертность

Mortality

MO

Спинномозговая жидкость

Cerebrospinal Fluid

CF

Стандарты

Standards

ST

Статистика и численные данные

Statistics and Numerical Data

SN

Сцинтиграфия

Radionuclide Imaging

RI

Тенденции

Trends

TD

Терапевтическое использование

Therapeutic Use

TU

Терапия

Therapy

TH

Токсичность

Toxicity

TO

Трансплантация

Transplantation

TR

Ультразвуковое исследование

Ultrasonography

US

Ультраструктура

Ultrastructure

UL

Фармакокинетика

Pharmacokinetics

PK

Фармакология

Pharmacology

PD

Физиология

Physiology

PH

Химически индуцированный

Chemically Induced

CI

Химический синтез

Chemical Synthesis

CS

Химия

Chemistry

CH

Хирургия

Surgery

SU

Цитология

Cytology

CY

Экономика

Economics

EC

Эмбриология

Embryology

EM

Энзимология

Enzymology

EN

Эпидемиология

Epidemiology

EP

Этиология

Etiology

ET

Этнология

Ethnology

EH

Надо отметить, что, как и MESH термины, подзаголовки объединяются в иерархические структуры таким образом, что указание на подзаголовок более высокого уровня приводит к формированию серии запросов как с этим подзаголовком, так и всеми подзаголовками, подчиненными ему. Поэтому запрос hypertension/therapy вернет не только статьи, отвечающие этому запросу, но и соответствующие запросам hypertension/diet therapy; hypertension/drug therapy; hypertension, malignant/therapy; hypertension, malignant/drug therapy и т.д.

В принципе, можно запретить раскрытие дерево заголовков используя ключевое слово noexp, например analysis [SH:noexp]

Семейства подзаголовков приведены в табл. 2

adverse effects etiology physiology
Poisoning Chemically induced genetics
toxicity complications growth and development
analysis secondary immunology
blood congenital metabolism
cerebrospinal fluid embriology biosynthesis
isolation and purification genetics blood
urine immunology cerebrospinal fluid
anatomy and histology microbiology deficiency
blood supply virology enzymology
cytology parasitology pharmacokinetics
pathology transmission urine
ultrastructure metabolism physiopathology
embriology biosynthesis secretion
abnormalities blood
innervation cerebrospinal fluid statistics and numerical data
chemistry deficiency epidemiology
agonists enzymology ethnology
analogs and derivatives pharmacokinetics mortality
antagonists and inhibitors urine supply and distribution
chemical synthesis microbiology utilization
complications virology
secondary organization and admin surgery
economics transplantation
cytology legislation and juris
pathology manpower therapeutic use
ultrastructure standards admin and dosage
supply and distribution adverse effects
diagnosis trends contraindications
pathology utilization poisoning
radiography pharmacology
radionuclide imaging admin and dosage therapy
ultrasonography adverse effects diet therapy
poisoning drug therapy
embriology toxicity nursing
abnormalities agonists prevention and control
antagonists and inhib radiotherapy
epidemiology contraindications rehabilitation
ethnology diagnostic use surgery
mortality pharmacokinetics transplantation

Поле "Текстовое слово" [TW]

Данное поле включает все слова и цифры, встречающиеся в заголовке, резюме статьи, MESH термины, подзаголовки, наименования химических соединений и слова в поле "Имя как тема" [PS]. Поле PS позволяет искать фамилии людей, которым посвящена работа, например статью о Флоренс Найтингел можно искать либо используя идентификатор "текстовое слово", либо идентификатор [PS], например Nightingale F [PS].

Поиск при помощи поля "текстовое слово" является весьма чувствительным, но крайне мало специфичным и, соответственно, результатом может явиться получение выборки из слишком большого количества ссылок.

Поле "Слово в заголовке" [TI]

Включает слова и цифры, содержащиеся в заголовке статьи. Удобно для поиска работы по назаванию.

Поле "Слово в заголовке или резюме" [TIAB]

Это поле содержит информацию о словах, которые содержатся в заголовке статьи и/или резюме статьи. Данное поле удобно для поиска статей, описывающих фирменные наименования лекарственных средств или новых лекарственных средств, которые еще не попали в словарь MESH, а также иных редко встречающихся терминов.

Поле «Тип публикации» [PT]

Учитывая, что полезность медицинской информации прямо пропорциональна ее достоверности и обратно пропорциональна той работе, которую надо затратить для нахождения этой информации, любые индикаторы качества публикации в библиографической системе являются большим подспорьем.

Табл. 3 Виды публикаций, индексируемые в системе MEDLINE

Значение поля

Русский эквивалент

Addresses

Обращения

Bibliography

Библиография

Biography

Биография

Classical Article

Классическая работа (повторно опубликованные важнейшие работы)

Clinical Conference

Клинико-патологическая конференция (описание случаев)

Clinical Trial

Клинические испытания (включает все типы и фазы клинических испытаний)

Clinical Trial, Phase I

Клинические испытания, I стадия

Clinical Trial, Phase II

Клинические испытания, II стадия

Clinical Trial, Phase III

Клинические испытания, III стадия

Clinical Trial, Phase IV

Клинические испытания, IV стадия

Congresses

Конгрессы

Controlled Clinical Trial

Контролируемые клинические испытания

Randomized Controlled Trial

Рандомизированные контролируемые испытания

Comment

Комментарии (к ранее опубликованным статьям)

Consensus Development Conference

Совещание экспертов

Consensus Development Conference, NIH

Совещание экспертов, Национальные институты здоровья США

Corrected and Republished Article

Исправленные и заново опубликованные работы

Dictionary

Словарь

Directory

Справочник

Duplicate Publication

Двойная публикация (повторение материала, опубликованного еще где-либо)

Editorial

Редакционная статья

Guideline

Руководство (для административных и общих руководств)

Historical Article

Историческая статья (статья, посвященная произошедшим в прошлом событиям)

Interview

Интервью

Journal Article

Журнальная статья

Lectures

Лекция

Legal Cases

Случаи из юридической практики (включая описания законодательства)

Letter

Письма (включая письма в редакцию)

Meeting Abstract

Тезисы конференций

Meta-Analysis [quantitative summary combining results of independent studies]

Мета-анализ (количественное суммирование результатов независимых исследований)

Multicenter Study

Многоцентровое исследование

News

Новости (научные или медицинские)

Newspaper Article

Газетная статья

Periodical Index

Оглавление (для кумулятивных оглавлений в журналах)

Practice Guideline

Клинические руководства (руководства по оказанию помощи в здравоохранении)

Published Erratum

Опубликованные исправления

Retracted Publication

Отозванная публикация (статьи, позднее отозванные автором)

Retraction of Publication

Отзыв публикации (заявление автора об отзыве статьи)

Review

Обзор (включает все виды обзоров, лучше пользоваться более узкими определениями)

Review, Academic

Академический обзор (всеобъемлющий критический или аналитический обзор)

Review, Multicase

Обзор случаев (обзор с эпидемиологическими данными)

Review of Reported Cases

Описание случаев заболеваний (описание известных случаев данного заболевания

Review Literature

Обзор литературы (общий термин для обзоров литературы)

Review, Tutorial

Учебный обзор (широкий обзор для неспециалистов или студентов)

Scientific Integrity Review

Обзор научной состоятельности (отчеты офиса контроля качества научной деятельности)

Technical Report

Технические отчеты

Twin Study

Исследования близнецов

 

 

Далее...